SARS-CoV-2: Gaano Kalubha ang variant ng B.1.1.529, na ngayon ay pinangalanang Omicron

Ang variant ng B.1.1.529 ay unang naiulat sa WHO mula sa South Africa noong 24^th Nobyembre 2021. Ang unang kilalang nakumpirmang B.1.1.529 na impeksyon ay mula sa isang ispesimen na nakolekta noong 9^th Nobyembre 2021¹. Isa pang source² ay nagpapahiwatig na ang variant na ito ay unang nakita sa mga sample na nakolekta noong 11^th Nobyembre 2021 sa Botswana at noong 14^th Nobyembre 2021 sa South Africa. Simula noon, ang bilang ng mga kaso ng COVID-19 ay tumaas nang husto sa halos lahat ng mga lalawigan sa South Africa. Tulad noong 27^th Nobyembre 2021, naiulat din ang mga bagong kaso ng variant na ito sa Belgium, Hong Kong, Israel, United Kingdom³, Germany, Italy at Czech Republic na lahat ay nauugnay sa paglalakbay sa pinanggalingan.  

Salamat sa mga awtoridad sa South Africa para sa hindi paglalaan ng oras sa pakikipag-usap at pagbabahagi ng may-katuturang impormasyon sa pandaigdigang komunidad na siyentipiko upang ang grupo ng dalubhasa ng WHO ay makapagpulong sa 26^th Nobyembre 2021 at mabilis na italaga ang variant na ito bilang Variant of concern (VOC). Ang kaseryosohan ng usapin ay maaaring masukat mula sa katotohanan na ang B.1.1.529 ay itinalagang isang variant under monitoring (VUM) dalawang araw lamang ang nakalipas noong 24^th Nobyembre 2021 bago italaga bilang VOC noong 26^th Nobyembre 2021 nang hindi muna itinalaga bilang variant under investigation (VOI).  

Talahanayan: SARS-CoV-2 Variants of concern (VOC) noong Nobyembre 26, 2021 

Ang pagkaapurahan sa pagtatalaga ng B.1.1.529 bilang variant of concern (VOC) ay nabigyang-katwiran dahil napag-alaman na ang variant na ito ang pinaka-divergent na variant ng SARS-CoV-2 sa ngayon. Kung ikukumpara sa SARS-CoV-2 virus na orihinal na na-detect sa Wuhan, China, mayroon itong aabot sa 30 pagbabago sa amino acid, 3 maliliit na pagtanggal at 1 maliit na pagpasok sa spike protein. Sa mga pagbabagong ito, 15 ang matatagpuan sa receptor binding domain (RBD), ang bahagi ng virus na nagpapahintulot dito na makapasok sa mga selula ng tao, na humahantong sa impeksyon. Ang variant na ito ay mayroon ding ilang pagbabago at pagtanggal sa ibang mga genomic na rehiyon². Ang mga mutasyon ay napakalawak na maaari itong tawaging isang bagong strain, sa halip na isang variant. Ang hindi kapani-paniwalang mataas na dami ng spike mutations ay nangangahulugan ng mas mataas na posibilidad na makatakas mula sa mga kilalang antibodies na ginagawa ang variant na ito na isang bagay na labis na alalahanin.⁵.  

Ang pagbabago sa mga bagong variant ay karaniwan sa mga coronavirus. Ito ay palaging likas na katangian ng mga bagay para sa mga coronavirus na sumailalim sa mutation sa kanilang mga genome sa napakataas na rate, dahil sa kakulangan ng aktibidad ng proofreading nuclease ng kanilang mga polymerases; higit ang paghahatid, higit ang mga error sa pagtitiklop at samakatuwid ay mas maraming mutasyon ang naipon sa genome, na humahantong sa mga bagong variant. Ang mga coronavirus ng tao ay bumubuo ng mga mutasyon upang lumikha ng mga bagong variant sa kamakailang kasaysayan. Mayroong ilang mga variant na responsable para sa mga epidemya mula noong 1966, nang naitala ang unang yugto⁶. Ngunit, bakit ganoon kalawak ang mutation sa isang pagsabog? Maaaring, dahil ang variant ng B.1.1.529 ay nag-evolve sa panahon ng isang talamak na impeksyon ng taong immunocompromised, posibleng isang hindi nagamot na pasyente ng HIV/AIDS⁷.  

Anuman ang maaaring maging sanhi ng malawak na mutasyon, kung ang mabilis na rate ng pagkalat nito sa South Africa ay anumang indikasyon, ang ebolusyon ng variant na ito ay maaaring magkaroon ng napakalaking epekto sa immunity, transmissibility at virulence at pagiging epektibo ng mga kasalukuyang bakuna, na kasalukuyang ginagamit.  

Kung mananatiling epektibo ang mga umiiral na bakuna laban sa bagong variant na ito o kung magkakaroon ng higit pang mga pagkakataon ng mga impeksyon sa breakthrough ng bakuna, may kaunting data na kasalukuyang magagamit upang makagawa ng anumang konklusyon. Gayunpaman, sa isang kamakailang pag-aaral, ang isang sintetikong variant na may 20 mutasyon sa spike protein ay nagpakita ng halos kumpletong pagtakas mula sa mga antibodies.⁷. Ipinapahiwatig nito na ang bagong variant na B.1.1.529 na may mas mataas na mutasyon, ay maaaring magpakita ng makabuluhang pagbawas ng neutralisasyon ng mga antibodies. Ang bagong variant, gayunpaman, ay mukhang mas naililipat sa pamamagitan ng mabilis na rate kung saan pinalitan nito ang Delta variant sa South Africa, kahit na ang kasalukuyang data ay hindi sapat upang gumuhit ng anumang maaasahang pagtatantya. Katulad nito, hindi posibleng magkomento sa kalubhaan ng mga sintomas sa yugtong ito.  

Dahil sa katotohanan na ang Europe ay nababagabag na sa isang hindi karaniwang mataas na bilang ng mga kaso ng COVID 19 (dahil sa napakabilis na naililipat na delta variant) sa nakalipas na ilang linggo at ang mabilis na rate kung saan omicron (B.1.1.529) na variant ay kumalat sa South Africa kamakailan na pinapalitan ang delta variant, ilang bansa sa Europe kabilang ang UK, Germany at Italy ang nagpataw ng mga paghihigpit sa paglalakbay sa mga pagdating mula sa South Africa at mula sa mga kalapit na bansa tulad ng Botswana, Malawi, Mozambique, Zambia at Angola. Sa takot sa pinakamasama, ipagbawal ng Israel ang pagpasok ng mga bisita mula sa lahat ng mga bansa.  

Napakalaki ng namuhunan ng mundo sa pagbuo at pangangasiwa ng mga bakuna sa COVID-19 para protektahan ang mga tao mula sa pandemya. Ang tanong na pinakamataas sa isip ng mga siyentipiko at awtoridad ay kung ang pangunahing mga bakuna sa COVID-19 tulad ng Pfizer–BioNTech, Oxford–AstraZeneca, Moderna, Johnson & Johnson ay mananatiling epektibo laban sa Omicron (B.1.1.529) na variant din . Ito ay pinalakas ng katotohanan na ang mga impeksyon sa pambihirang tagumpay ay naiulat sa South Africa. Ang dalawang kaso ng Hong Kong ay nakatanggap din ng mga dosis ng bakuna⁹. 

Pagbuo ng mga bakunang "pan-coronavirus".¹⁰ (multivalent vaccine platforms¹¹) parang kailangan ng oras. Ngunit, nang mas mabilis, posibleng mabilis na makagawa ng mga booster dose ng mRNA at mga bakuna sa DNA na sumasaklaw sa mga mutasyon. Bilang karagdagan, ang kamakailang naaprubahan mga antiviral (Merck's Molnupiravir at Pfizer's Paxlovid) ay dapat na maging kapaki-pakinabang sa pagprotekta sa mga tao mula sa ospital at pagkamatay.   

 *** 

Sanggunian:  

1. WHO 2021. Balita – Klasipikasyon ng Omicron (B.1.1.529): Variant of Concern ng SARS-CoV-2. Na-publish noong Nobyembre 26, 2021. Available online sa https://www.who.int/news/item/26-11-2021-classification-of-omicron-(b.1.1.529)-sars-cov-2-variant-of-concern  

2. European Center para sa Pag-iwas at Pagkontrol sa Sakit. Mga implikasyon ng paglitaw at pagkalat ng SARSCoV-2 B.1.1. 529 variant of concern (Omicron), para sa EU/EEA. 26 Nobyembre 2021. ECDC: Stockholm; 2021. Available online sa https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/threat-assessment-brief-emergence-sars-cov-2-variant-b.1.1.529  

3. UK Govt 2021. Press release – Natukoy ang mga unang kaso sa UK ng variant ng Omicron. Nai-publish noong Nobyembre 27, 2021. Magagamit sa https://www.gov.uk/government/news/first-uk-cases-of-omicron-variant-identified   

4. WHO, 2021. Pagsubaybay sa mga variant ng SARS-CoV-2. Available online sa https://www.who.int/en/activities/tracking-SARS-CoV-2-variants/ 

5. GitHub, 2021. Thomas Peacock: B.1.1 decendant na nauugnay sa Southern Africa na may mataas na bilang ng Spike mutations #343. Available online sa https://github.com/cov-lineages/pango-designation/issues/343 

6. Prasad U.2021. Mga Variant ng Coronavirus: Ang Alam Natin Sa Ngayon. Siyentipikong European. Nai-post noong Hulyo 12, 2021. Available online sa http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/variants-of-coronavirus-what-we-know-so-far/ 

7. GAVI 2021. Trabaho sa bakuna – Ano ang alam natin tungkol sa bagong B.1.1.529 na variant ng coronavirus at dapat ba tayong mag-alala? Available sa https://www.gavi.org/vaccineswork/what-we-know-about-new-b11529-coronavirus-variant-so-far 

8. Schmidt, F., Weisblum, Y., Rutkowska, M. et al. Mataas na genetic barrier sa SARS-CoV-2 polyclonal neutralizing antibody escape. Kalikasan (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-04005-0 

9. Ang mabigat na mutated na variant ng coronavirus ay naglalagay sa mga siyentipiko sa alerto. Kalikasan News. Na-update noong Nobyembre 27, 2021. DOI: https://doi.org/10.1038/d41586-021-03552-w  

10. Soni R. 2021. Mga bakuna na "Pan-coronavirus": Ang RNA Polymerase ay Lumilitaw bilang Target ng Bakuna. Siyentipikong European. Na-publish noong Nobyembre 16, 2021. Magagamit sa http://scientificeuropean.co.uk/covid-19/pan-coronavirus-vaccines-rna-polymerase-emerges-as-a-vaccine-target/  

11. NIH 2021. Paglabas ng balita – Nag-isyu ang NIAID ng mga bagong parangal para pondohan ang mga bakunang “pan-coronavirus”. Nai-post noong Setyembre 28, 2021. Magagamit sa https://www.nih.gov/news-events/news-releases/niaid-issues-new-awards-fund-pan-coronavirus-vaccines  

***