Ang oras ng pagsusuri ay lubos na nababawasan mula halos isang oras hanggang ilang minuto ng bagong iniulat na pamamaraang RTF-EXPAR na gumagamit ng reverse transcriptase-free (RTF) na diskarte para sa conversion ng RNA sa DNA na sinusundan ng EXPAR (Exponential Amplification Reaction) para sa amplification sa iisang temperatura.
Pagkontrol sa rate ng Covid-19 Ang pagkalat ay nangangailangan ng tumpak at mas mabilis na diskarte sa pagsubok ng virus. RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction), ang pinakatumpak na paraan ng pagsubok na kasalukuyang ginagamit ay isang dalawang hakbang na pagsubok na tumatagal ng humigit-kumulang 60 minuto bawat sample.
Ang mga mananaliksik mula sa Unibersidad ng Birmingham ay nag-ulat ng isang nobelang pamamaraan para sa pagtuklas ng SARS-CoV-2. Maaari nitong paganahin ang mas mabilis na pagsubok at sapat na sensitibo.
Ang pagtuklas ng viral RNA sa pamamagitan ng RT-PCR (reverse transcriptase polymerase chain reaction) ay nagsasangkot ng conversion ng viral RNA sa complementary DNA (cDNA) na sinusundan ng amplification ng cDNA ng isang quantitative PCR (qPCR). Ang cDNA ay pagkatapos ay nakita gamit ang isang fluorescent dye. Ito ay tumatagal ng hanggang isang oras.
Ang oras ng assay ay makabuluhang nababawasan mula halos isang oras hanggang ilang minuto ng bagong iniulat na pamamaraang RTF-EXPAR na gumagamit ng reverse transcriptase-free (RTF) na diskarte para sa conversion ng RNA sa DNA na sinusundan ng EXPAR (Exponential Amplification Reaction) para sa amplification sa iisang temperatura. Ang amplification na nagaganap sa isang temperatura ay ang susi sa bilis, dahil iniiwasan nito ang mahabang hakbang sa pag-init at paglamig ng RT-PCR. Dagdag pa, ang seksyon ng DNA na pinapalaki ay mas maliit kumpara sa RT-PCR. Kaya naman, ang EXPAR ay bumubuo ng hanggang 108 strand ng produkto ng DNA sa ilang minuto. Ang pagbuo ng duplex ay sinusubaybayan, tulad ng sa RT-PCR na pamamaraan gamit ang fluorescent dye, SYBR Green.
Kapansin-pansin, ang bagong paraan ay maaaring baguhin upang makita ang ilang iba pang mga nakakahawang sakit na dulot ng mga RNA virus, halimbawa Ebola, RSV, atbp.
Mga pinagkukunan (s):
Carter et al (2020). Sub-5 minutong Detection ng SARS-CoV-2 RNA gamit ang isang Reverse Transcriptase-Free Exponential Amplification Reaction, RTF-EXPAR. Preprint. Nai-publish sa medRxiv Na-post noong Enero 04, 2021. DOI: https://doi.org/10.1101/2020.12.31.20248236
***
