ADVERTISEMENT

Mga pagsusuri sa diagnostic para sa COVID-19: Isang Pagsusuri ng Mga Kasalukuyang Paraan, Mga Kasanayan at Hinaharap

Ang mga pagsusuri sa laboratoryo para sa diagnosis ng COVID-19 na kasalukuyang isinasagawa ayon sa payo ng mga internasyonal na katawan ng mga eksperto ay sinusuri at sinusuri.

Ang COVID-19 sakit, na nagmula sa Wuhan China, ay nakaapekto sa higit sa 208 mga bansa hanggang ngayon. Ang komunidad na pang-agham sa buong mundo ay may malaking hamon sa nakalipas na ilang buwan, na umunlad mga pagsubok sa diagnostic para Covid-19 pagtuklas ng sakit upang ma-screen ang mga pasyente at pinaghihinalaang indibidwal upang epektibong pamahalaan at makontrol ang pandemya.

Bago natin suriin ang mga kasalukuyang pamamaraan at kasanayan na ginagamit para sa pagtuklas ng COVID-19, unawain muna natin kung ano ang sanhi ng COVID-19 at kung paano bubuo ang isang tao ng mga diagnostic na pagsusuri upang masuri ang mga pasyente para sa sakit na ito. Ang sakit na COVID-19 ay sanhi ng isang positibong stranded na RNA virus na zoonotic, na nangangahulugang maaari silang tumawid sa mga hadlang ng mga species mula sa mga hayop patungo sa mga tao, at maaaring magdulot, sa mga tao, ng sakit mula sa karaniwang sipon hanggang sa mas malalang sakit tulad ng MERS at SARS. Ang virus na nagdudulot ng COVID-19 ay pinangalanan na ngayon ng SARS-CoV-2 ng International Committee of Taxonomy of Viruses (ICTV), dahil halos kapareho ito sa naging sanhi ng pagsiklab ng SARS (SARS-CoVs). Ang diagnostic test para sa sakit na COVID-19 ay maaaring mabuo sa maraming paraan.

Ang pinakasikat at kasalukuyang pinagtibay na paraan sa buong mundo ay ang pagbuo ng diagnostic test na maaaring makakita ng SARS-CoV-2 virus mismo. Ito pagsusulit ay batay sa pagtuklas ng viral genome sa sample ng pasyente sa pamamagitan ng RT-real time PCR (reverse transcriptase-real time Polymerase Chain Reaction). Nangangailangan ito ng conversion ng viral RNA sa DNA gamit ang isang enzyme na tinatawag na reverse transcriptase at pagkatapos ay palakasin ang DNA gamit ang partikular na hanay ng mga primer at fluorescent probe, na nagbubuklod sa isang partikular na rehiyon sa viral DNA, gamit ang isang Taq polymerase at pag-detect ng fluorescent signal. Ang mga pagsubok na ito ay tinutukoy bilang NAATs (Nucleic Acid Amplification Tests). Ang diskarteng ito ay maaaring maging lubhang kapaki-pakinabang para sa napakaagang pagtuklas ng pagkakaroon ng nucleic acid sa sample ng pasyente, kahit na sa mga pasyenteng walang sintomas na hindi nagpapakita ng mga sintomas ng sakit na COVID-19 (lalo na sa incubation period na 14-28 araw) at sa huling bahagi. pati na rin kapag ang sakit ay ganap na.

Ang iba't ibang kumpanya sa buong mundo ay nagtatrabaho sa isang karera laban sa oras sa nakalipas na ilang buwan upang bumuo ng NAAT based diagnostic test para sa pagtuklas ng SARS-CoV-2 batay sa CDC (Centre for Disease Control), Atlanta, USA at mga alituntunin ng WHO ( 1, 2). Inaprubahan ng mga awtoridad sa kalusugan sa buong mundo ang mga pagsusuring ito para sa emergency na paggamit para sa pagtuklas ng SARS-CoV-2. Ang mga viral gene na naka-target sa ngayon ay kinabibilangan ng N, E, S at RdRP genes, kasama ang naaangkop na positibo at negatibong mga kontrol. Ang mga sample ng pasyente na kokolektahin para sa naturang pagsusuri ay mula sa upper respiratory tract (nasopharyngeal at oropharyngeal swab) at/o lower respiratory tract (sputum at/o endotracheal aspirate o bronchoalveolar lavage). Gayunpaman, posible ring makakita ng virus sa iba pang mga sample, kabilang ang dumi at dugo. Ang mga sample ay kailangang mabilis na kolektahin sa naaangkop na paraan na ginagawa ang lahat ng kinakailangang pag-iingat at pagsunod sa mga kasanayan sa biosafety (ayon sa mga alituntuning itinakda ng WHO[1]), mula sa mga pasyente na nakakatugon sa pinaghihinalaang kahulugan ng kaso para sa COVID-19, pag-iingat at pag-package nito. mabuti kung kailangan itong dalhin sa diagnostic center at pagkatapos ay iproseso (pagkuha ng RNA sa isang biosafety cabinet sa isang BSL-2 o katumbas na pasilidad) nang mabilis sa paraang matiyak ang integridad ng sample. Ang lahat ng ito ay kailangang gampanan sa isang priyoridad na batayan para sa mas mahusay na klinikal na pamamahala at kontrol ng outbreak.

Ang oras ng pagtuklas para sa iba't ibang available na pagsubok na nakabatay sa NAAT na binuo ng mga pangunahing kumpanya ng diagnostic sa buong mundo ay nag-iiba mula 45 min hanggang 3.5 na oras. Ang iba't ibang pagpapabuti ay ginagawa sa mga pagsusulit na ito upang i-convert ang mga ito sa mga pagsusuri sa punto ng pangangalaga at makamit ang ninanais na mga resulta sa mas kaunting oras hangga't maaari nang hindi nakompromiso ang katumpakan ng resulta, upang madagdagan ang bilang ng mga pagsubok na maaaring gawin sa isang araw.

Ang iba pang mga opsyon sa diagnostic test ay mga rapid diagnostic test (RDTs) na maaaring makakita ng mga viral antigen/protina na ipinahayag sa ibabaw ng mga particle ng virus ng SARS-CoV-2 habang ang mga ito ay gumagaya sa mga host cell at nagdudulot ng sakit o host antibodies bilang tugon sa impeksyon; nakita ng pagsusuring ito ang pagkakaroon ng mga antibodies sa dugo ng mga taong pinaniniwalaang nahawaan ng COVID-19 (3).

Ang katumpakan at reproducibility ng RDT upang makita ang mga viral antigen ay depende sa ilang mga kadahilanan kabilang ang oras mula sa pagsisimula ng sakit, ang konsentrasyon ng virus sa sample, ang kalidad at pagproseso ng sample, at ang pagbabalangkas ng mga reagents na nasa mga test kit. Dahil sa mga variable na ito, maaaring mag-iba ang sensitivity ng mga pagsubok na ito mula 34% hanggang 80%. Ang isang pangunahing disbentaha ng pagpipiliang ito ay ang virus ay kailangang nasa kanyang replicative at infective na yugto upang makita ang mga viral protein.

Katulad nito, ang mga pagsusuri na nakakakita ng mga antibodies ng host ay batay sa lakas ng pagtugon ng antibody na nakadepende sa mga salik gaya ng edad, katayuan sa nutrisyon, kalubhaan ng sakit, at ilang partikular na gamot o impeksyon na pumipigil sa immune system. Ang isang pangunahing disbentaha ng opsyong ito ay ang mga antibodies ay nagagawa sa paglipas ng mga araw hanggang linggo pagkatapos ng impeksyon ng SARS-CoV-2 na virus at kailangang maghintay ng ganoon katagal upang maisagawa ang pagsusuri. Nangangahulugan ito na ang diagnosis ng impeksyon sa COVID-19 batay sa tugon ng host antibody ay kadalasang magiging posible lamang sa yugto ng pagbawi, kapag lumipas na ang marami sa mga pagkakataon para sa klinikal na interbensyon o pag-iwas sa paghahatid ng sakit.

Sa kasalukuyan, ang mga RDT na nabanggit sa itaas ay naaprubahan lamang sa isang setting ng pananaliksik at hindi para sa klinikal na diagnosis dahil sa kakulangan ng data (3, 4). Habang parami nang parami ang epidemiological data na nagiging available para sa COVID-19, mas maraming RDT ang bubuo at maaaprubahan bilang mga pagsubok sa punto ng pangangalaga sa isang klinikal na setting dahil makakapagbigay sila ng mga resulta sa loob ng 10-30 minuto kumpara sa mga pagsubok na nakabatay sa NAAT na sa karaniwan ay tumatagal. ilang oras para matukoy ang sakit.

***

Sanggunian:
1. WHO, 2020. Mga Rekomendasyon sa Diskarte sa Pagsusuri sa Laboratory para sa COVID-19. Pansamantalang Patnubay. 21 Marso 2020. Available online sa https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/331509/WHO-COVID-19-lab_testing-2020.1-eng.pdf Na-access noong 09 Abril 2020
2. CDC 2020. Impormasyon para sa mga laboratoryo. Pansamantalang Patnubay para sa mga Laboratoryo Makukuha online sa https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-nCoV/lab/index.html Na-access noong 09 Abril 2020.
3. WHO, 2020. Payo sa Paggamit ng Point of Care Tests. Maikling Siyentipiko. 08 Abril 2020. Available online sa https://www.who.int/news-room/commentaries/detail/advice-on-the-use-of-point-of-care-immunodiagnostic-tests-for-covid-19 Na-access noong 09 Abril 2020.
4. ECDC, 2020. Isang Pangkalahatang-ideya ng Sitwasyon ng Rapid Test para sa Diagnosis ng COVID-19 sa EU/EEA. 01 Abril 2020. European Center para sa pag-iwas at pagkontrol sa sakit. Available online sa https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/overview-rapid-test-situation-covid-19-diagnosis-eueea Na-access noong 09 Abril 2020

***

Rajeev Soni
Rajeev Sonihttps://www.RajeevSoni.org/
Si Dr. Rajeev Soni (ORCID ID : 0000-0001-7126-5864) ay mayroong Ph.D. sa Biotechnology mula sa University of Cambridge, UK at may 25 taong karanasan sa pagtatrabaho sa buong mundo sa iba't ibang institute at multinational tulad ng The Scripps Research Institute, Novartis, Novozymes, Ranbaxy, Biocon, Biomerieux at bilang principal investigator sa US Naval Research Lab sa pagtuklas ng droga, mga diagnostic ng molekular, pagpapahayag ng protina, pagmamanupaktura ng biologic at pagpapaunlad ng negosyo.

Mag-subscribe sa aming newsletter

Upang mai-update sa lahat ng mga pinakabagong balita, alok at mga espesyal na anunsyo.

Pinakatanyag na Akda

COVID-19: Paggamit ng Hyperbaric Oxygen Therapy (HBOT) sa Paggamot ng Malalang Kaso

Ang pandemya ng COVID-19 ay nagdulot ng malaking epekto sa ekonomiya sa lahat ng...

Heinsberg Study: Infection Fatality Rate (IFR) para sa COVID-19 Determined for the First Time

Ang infection fatality rate (IFR) ay mas maaasahang tagapagpahiwatig...

NeoCoV: Ang Unang Kaso ng MERS-CoV Related Virus gamit ang ACE2

NeoCoV, isang coronavirus strain na nauugnay sa MERS-CoV na natagpuan sa...
- Advertisement -
94,445Mga Tagahangakatulad
47,677Mga tagasunodsundin
1,772Mga tagasunodsundin
30Subscribersumuskribi